1. Незалежна оцінка стану та перспектив розвитку АПК в зоні своєї діяльності та розроблення пропозицій, прогнозів щодо його науково-інноваційного розвитку.
2. Визначення проблем для програмного вирішення, розроблення концепцій та проектів регіональних науково-технічних програм, підготовка їх до розгляду відповідних органів державної влади та участь в організації їх виконання.
3. Координація фундаментальних і прикладних наукових досліджень з проблем, що мають важливе значення для розвитку АПК в зоні діяльності Центру.
4. Аналіз стану аграрної науки в зоні своєї діяльності. За результатами аналізу здійснення заходів, спрямованих на збереження та подальший розвиток наукового потенціалу регіону, в тому числі:
- сприяння розвитку міжрегіональних наукових зв'язків учених регіону;
- організація колективного користування системами інформаційного забезпечення, науковими приладами і обладнанням.
5. Науково-методичне керівництво роботою наукових установ і організацій, що входять до Центру, зокрема, організація:
- випробування, доопрацювання науково-технічних розробок з урахуванням регіональних особливостей;
- трансферу високоефективних технологій та інших наукових розробок науковими установами Центру, діяльності по забезпеченню захисту прав інтелектуальної власності;
- формування банку даних високоефективних науково-технічних розробок та інновацій, які мають перспективне значення для АПК регіону та України в цілому;
- пропаганди результатів наукових досліджень, нових прогресивних форм науково-технічної діяльності, проведення конференцій, нарад, семінарів, виставок, функціонування науково-технологічних полігонів, показових ферм тощо;
- підвищення кваліфікації керівників і спеціалістів АПК у сфері інноваційної діяльності, інтелектуальної власності та трансферу технологій;
- моніторинг діяльності наукових установ і організацій, які регіонально підпорядковані Центру.
6. Розроблення планів заходів з організації та розвитку інноваційної інфраструктури на регіональному рівні.